ভিডিও: একটি BAM সূচক ফাইল কি?
2024 লেখক: Lynn Donovan | [email protected]. সর্বশেষ পরিবর্তিত: 2023-12-15 23:44
ক BAM ফাইল (. ব্যাম ) একটি SAM এর বাইনারি সংস্করণ ফাইল . একটি SAM ফাইল (. sam) একটি ট্যাব-বিন্যস্ত পাঠ্য ফাইল যে ক্রম প্রান্তিককরণ তথ্য রয়েছে. ইনডেক্সিং : IGV উভয় SAM এবং BAM ফাইল অবস্থান অনুসারে সাজানো হবে এবং সূচিত , এবং যে ইনডেক্স ফাইল একটি নির্দিষ্ট নামকরণ রীতি অনুসরণ করুন।
একইভাবে, লোকেরা জিজ্ঞাসা করে, আমি কীভাবে একটি BAM ফাইল খুলব?
থেকে ফাইল মেনু নির্বাচন করুন খোলা এবং নির্বাচন করুন BAM ফাইল বাম পাশ থেকে। ডানদিকে একটি নির্বাচন করুন বোতামটি যোগ করুন BAM ফাইল . নেভিগেট করুন বিএএম পরীক্ষা নথি পত্র আপনি যে ফোল্ডারটি ডাউনলোড করেছেন তা নির্বাচন করুন with_index_with_graph. ক্লিক খোলা , মানচিত্র নির্বাচন করুন।
দ্বিতীয়ত, আমি কিভাবে একটি BAM ফাইলকে Fastq এ রূপান্তর করব? নীচে BAM ফাইলকে FASTQ ফর্ম্যাটে রূপান্তর করার পদক্ষেপগুলি রয়েছে৷ এটি লিনাক্সে কাজ করবে এবং SAMTOOLS এবং BEDTOOLS এর প্রয়োজন হবে
- SAMTOOLS ডাউনলোড করুন।
- কমান্ড tar xzvf samtools-version.tar.bz2 ব্যবহার করে নিষ্কাশন করুন।
- এটি samtools-version নামে একটি ফোল্ডার তৈরি করবে।
- সিডি samtools-সংস্করণ ডিরেক্টরিতে যান।
একইভাবে, আমি কিভাবে একটি BAM ফাইলকে SAM ফাইলে রূপান্তর করব?
প্রতি SAM রূপান্তর করুন প্রতি বিএএম , আমরা samtools view কমান্ড ব্যবহার করি। আমাদের অবশ্যই উল্লেখ করতে হবে যে আমাদের ইনপুট আছে SAM বিন্যাস (ডিফল্টরূপে এটি আশা করে বিএএম ) -S বিকল্প ব্যবহার করে। আমরা এটাও বলতে চাই যে আমরা আউটপুট হতে চাই বিএএম (ডিফল্টরূপে এটি উত্পাদন করে বিএএম ) -b বিকল্পের সাথে।
Samtools ভিউ কি করে?
Samtools হল ইউটিলিটিগুলির একটি সেট যা BAM বিন্যাসে সারিবদ্ধকরণগুলি পরিচালনা করে। এটি SAM (সিকোয়েন্স অ্যালাইনমেন্ট/ম্যাপ) ফর্ম্যাটে থেকে আমদানি এবং রপ্তানি করে, করে বাছাই, একত্রীকরণ এবং সূচীকরণ, এবং যেকোনো অঞ্চলে দ্রুত পঠন পুনরুদ্ধার করার অনুমতি দেয়। Samtools একটি প্রবাহে কাজ করার জন্য ডিজাইন করা হয়েছে।
প্রস্তাবিত:
একটি TIFF ফাইল একটি ভেক্টর ফাইল?
টিআইএফ - (বা টিআইএফএফ) ট্যাগড ইমেজ ফাইল ফরম্যাটের জন্য দাঁড়িয়েছে এবং এটি একটি বড় রাস্টার ফাইল। একটি টিআইএফ ফাইল প্রাথমিকভাবে মুদ্রণের জন্য চিত্রগুলির জন্য ব্যবহৃত হয় কারণ ফাইলটি JPEG এর মতো তথ্য বা গুণমান হারায় না। এটি একটি ভেক্টর ভিত্তিক ফাইল যাতে পাঠ্যের পাশাপাশি গ্রাফিক্স এবং চিত্রগুলিও থাকতে পারে
আপনি একটি টেবিল পরিবর্তনশীল একটি সূচক তৈরি করতে পারেন?
একটি টেবিল ভেরিয়েবলে একটি সূচক তৈরি করা একটি প্রাথমিক কী সংজ্ঞায়িত করে এবং অনন্য সীমাবদ্ধতা তৈরি করে টেবিল ভেরিয়েবলের ঘোষণার মধ্যে অন্তর্নিহিতভাবে করা যেতে পারে। আপনি একটি ক্লাস্টার সূচকের সমতুল্যও তৈরি করতে পারেন। এটি করতে, শুধুমাত্র ক্লাস্টার সংরক্ষিত শব্দ যোগ করুন
আপনি কিভাবে একটি ArrayList থেকে একটি সূচক অপসারণ করবেন?
রিমুভ (int index) - নির্দিষ্ট সূচকে অ্যারেলিস্ট থেকে উপাদান সরান। এই পদ্ধতিটি এই তালিকার নির্দিষ্ট অবস্থানে নির্দিষ্ট উপাদান E সরিয়ে দেয়। এটি বর্তমানে সেই অবস্থানে থাকা উপাদানটিকে সরিয়ে দেয় এবং পরবর্তী সমস্ত উপাদান বাম দিকে সরানো হয় (তাদের সূচকে একটি বিয়োগ করবে)। সূচক 0 দিয়ে শুরু
এসকিউএল-এ সূচক এবং তৈরি সূচক কী?
এসকিউএল সূচক বিবৃতি তৈরি করুন. CREATE INDEX স্টেটমেন্টটি টেবিলে সূচী তৈরি করতে ব্যবহৃত হয়। ডাটাবেস থেকে ডাটা পুনরুদ্ধার করতে সূচীগুলি ব্যবহার করা হয় অন্যথায়। দ্রষ্টব্য: সূচী সহ একটি টেবিল আপডেট করা ছাড়া একটি টেবিল আপডেট করার চেয়ে বেশি সময় লাগে (কারণ সূচীগুলিরও একটি আপডেটের প্রয়োজন)
একটি ক্লাস্টারিং সূচক এবং একটি গৌণ সূচক মধ্যে পার্থক্য কি?
প্রাথমিক সূচী: একটি ক্রমানুসারে অর্ডার করা ফাইলে, যে সূচীটির অনুসন্ধান কী ফাইলের অনুক্রমিক ক্রম নির্দিষ্ট করে। এছাড়াও ক্লাস্টারিং সূচক বলা হয়। সেকেন্ডারি ইনডেক্স: একটি সূচক যার অনুসন্ধান কী ফাইলের অনুক্রমিক ক্রম থেকে ভিন্ন একটি আদেশ নির্দিষ্ট করে। নন-ক্লাস্টারিং সূচকও বলা হয়